今天分享一篇最近比较热门的日本创业公司Sakana AI的一篇文章，标题为《The AI Scientist: Towards Fully Automated Open-Ended Scientific Discovery》。文章提出了一种名为“AI Scientist”的框架，旨在实现端到端完全自动化的科学发现，完成从Idea构建，实验跑取，文章撰写的完全自动化。验证了AI自动化探索新问题，解决新问题，甚至撰写Paper的可行性。同时还提出了一个能与人类评委水准接近的Review Agent，能够给出高水准的评审意见。

总体来说，其还是一个多agent系统，利用了reflection机制迭代优化效果，同时也结合Semantic Scholar等工具验证创新性，利用Aider工具来更新代码和Paper，来执行相关实验。同时也要看到其只是搭了一个基础的Baseline通道，如何提升Idea生成的深度以及多样性，如何让LLM能实现更复杂，更有挑战性的Idea，如何降低Review Agent的False Positive Rate（FPR）都值得进一步探索。

本文将对其背后的技术，优缺点进行详细的分析～

一、概述

1. Motivation

文章介绍了“AI科学家”框架，该框架包括三个主要阶段：

1.想法生成：AI科学家首先“头脑风暴”出一系列新颖的研究方向，然后在此基础上进行创新性迭代优化，最后筛选创新性较高的idea。

2.实验迭代：根据想法和模板，AI科学家首先执行提出的实验plan，然后根据实验结果，迭代优化实验，最后更新plot代码，可视化其结果以供后续撰写，代码通过AIder工具来更新。

3.论文撰写：AI科学家使用LaTeX撰写完整的科学论文，描述其进展。

•输入：总体就两个输入，Baseline Code，以及论文Latex模板，加上init paper的一些信息。

• Baseline code：a starting code template that reproduces a lightweight baseline training run from a popular model or benchmark. For example, this could be code thattrains a small transformeron the works of Shakespeare (Karpathy, 2022), a classic proof-of-concept training run from natural language processing that completes within a few minutes

• Latex模版：LaTeX folder that containsstyle files and section headers, along with simple plotting code.

•输出：完整的Paper

1 Idea generate过程

•输入：code template

•输出：some ideas

•代码：​ ​​ ​

• generate_ideas：idea生成

• generate_next_idea：在seed的基础上继续生成新的idea

• search_for_papers：调用api search paper

• check_idea_novelty：检查并优化创新性

1.1 Idea Generation Prompt

•优点：对diversity做了优化和限制，引入了COT机制。

•缺点：idea全靠LLM内部信息想出来，思考的知识有限，更新也不及时，不太能及时follow最新知识，不过内部知识能做到什么粒度其实还不太确定，另外内部知识其实是缺乏新知识的，这对科学研究非常致命。

1.2 Idea Novelty Prompt

•缺点：还是创新全部源于LLM内部知识。

2 Experiments过程

•输入：idea + template

•输出：experiment result + experiment figures

•实现方式：通过Aider更新代码，然后执行命令行跑取模型结果。

• Aider平台，可以通过命令更新代码：•

2.1 Experiment Running Aider Prompt

•特点：先也会有一个plan，然后分别实现experiments

•缺点：没具体讲如何实现Experiment的，Aider看着是个平台，可能可以直接用，但是改代码很容易出错，稳定性存疑。

2.2 Plotting Aider Prompt

•特点：生成plot，还有description，后续用于添加到论文中。

3 Paper Writing流程

•输入：Latex模版 + Experiments recorded notes + plots，Latex模板图如下，也是用Aider工具来修改•

•输出：paper

3.1 Paper Writing Aider Prompt

•特点：提供每个section的建议+latex的template+plan

•缺点：Aider是个啥，感觉writing比较有用的样子。

4 Reviewer Agent流程

•输入：PDF manuscript

•输出：Paper Review Result

•优点：参考了neurips ReviewerGuidelines，同时引入reflection，few-shot来提升效果。

4.1 Paper Review Prompt

•特点：引入neurips guideline和few_shot_example。

4.2 Paper Review Reflection Prompt

•特点：经过多轮迭代 + COT思考

4.3 Paper Review Ensembling Prompt

•特点：还有个汇总的，优点self-consistant的感觉

5 反思和迭代次数

3. Coclusion

文章搭建了一个AI Scientist，通过三个子任务验证了其可行性：扩散模型、Transformer和Groking。并且每种想法的实现和开发成本不到15美元。表明了该框架在Research研究和显著加速科学进步方面的潜力。

•搭建了一个完整的科研链路Agent：idea -> Experiments -> Paper，还真work了。

•附带送了一个接近人类水平的Paper Review Agent，效果也还不错。

4. Limitation

•生成的Idea经常非常相似，甚至不同模型，不同run都会有很类似的idea。

• Aider实现ideas有困难，GPT-4o写Latext常不能编译，有些idea实现challenging比较大。

• plot的图像也可能有问题，而且还不止是vision，可能看不出效果。

• Latext的cite和reference可能有问题。

• LLM数学能力不太好，对metric不敏感。

•幻觉。

二、详细内容

1 LLM Paper Review水平在ICLR2022数据集上已经接近人类水平

•特点：精度和人类比较接近（balanced 0.65 vs 0.66），False Negative Rate（FNR）更低，False Positive Rate（FPR）偏高，说明也有打分偏高的情况。

2 Reflexion和one-shot能提升Reviewing效果

•结论：从0.66提升到0.70，看着还不错。Ensemble后精度没有提升，但是variance有降低。

3 Diffusion Modeling优化效果

•**结论1:Sonnet3.5看着比GPT-4o好很多啊，而且还更便宜，完成Paper率居然接近80%**，还是很厉害。

•结论2:DeepSeek Coder是性价比之王。

•其他：DIffusion Modeling感觉都是比较老的模型了，利用LLM生成的idea可能都是训练过的了，可能并不能代表真正的创新。

4 Language Modeling优化效果

•结论: 这次完成率只有40%了，这个差异好大，跟猜测的一样，coding可能非常不稳定，另外DeepSeek Coder确实厉害。

5 Grokking优化效果

•结论：不同paper，不同LLM基座的Noval Ideas居然都超过90%，但是Experiments的完成率差异非常大。​

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